綜合管理部（行政、人事、財務）：以綜合、協(xié)調(diào)、服務、聯(lián)絡、管理、日常接待為基本職能，起草制定年度工作計劃安排；組織制訂、修訂有關規(guī)章制度；服務、協(xié)調(diào)重要活動、項目和業(yè)務工作開展；為會領導提供辦公服務；負責文電、機要、印鑒、年檢、會務、檔案、安全保衛(wèi)等機關日常運行與管理工作；負責信息管理與網(wǎng)絡技術服務工作；組織企業(yè)家活動日和優(yōu)秀企業(yè)家評選表彰活動，開展和參與相關問題調(diào)研工作。
雇主工作部（突出維權）：本會專事雇主工作的職能部門，代表本會參加國家協(xié)調(diào)勞工關系三方會議，參加有關勞動關系重大問題協(xié)調(diào)；參與有關涉及勞動關系方面的法律法規(guī)和政策的制定，維護企業(yè)和企業(yè)家合法權益；指導與協(xié)調(diào)各地、各行業(yè)企聯(lián)/企業(yè)家協(xié)會開展三方機制建設和勞動關系協(xié)調(diào)工作；開展勞動關系調(diào)查和研究工作，組織開展三方機制和勞動關系方面的培訓和工作交流；組織開展誠信企業(yè)評價活動，推動企業(yè)誠信建設；動員中國企業(yè)參加聯(lián)合國全球契約及其國際、國內(nèi)活動，積極引導企業(yè)履行社會責任，提供社會責任咨詢、培訓服務；參與國際勞工組織有關活動，開展與其他有關國家雇主組織的交流與合作。
企業(yè)維權部：
項目開發(fā)部（商事，各項目組）：承擔綜合性研究和智力服務任務的業(yè)務部門，研發(fā)服務類產(chǎn)品，圍繞協(xié)會職能，運用市場營銷手段，負責協(xié)會重大項目的策劃、跟蹤、落實。
會員工作部（培訓、宣傳、政策）：本會負責會員發(fā)展、會員管理和會員服務的綜合服務部門。主要職能是：發(fā)展會員、建立同會員單位及理事會成員的密切聯(lián)系，管理會員數(shù)據(jù)庫；制定理事會及會員管理制度；組織會員單位參與本會活動；歸口為會員單位提供信息資料服務；反映企業(yè)和企業(yè)家訴求；收繳會費。同時，配合本會有關部門按期辦理年檢；為企業(yè)家開展健康促進工作提供科普宣教、健康管理、醫(yī)療協(xié)助、人才培養(yǎng)等多方面支持和服務。
縣區(qū)分支機構(gòu)：縣區(qū)辦事處，以設立人民調(diào)解中心、表彰先進、勞務派遣為結(jié)合點，在各縣區(qū)選擇威望企業(yè)作為機構(gòu)負責人，接受協(xié)會統(tǒng)一管理。
